Sujets de recherche

Mibiogate est un projet structurant de recherche préclinique. Il se décline sous le format d’une étude de faisabilité, du projet de 5 thèses et de 2 post-doctorats. Vous trouverez ci-dessous les objectifs globaux des projets de recherche puis le détail des sujets de thèses et post-doctorats.

1) Caractériser l’évolution des barrières d’organe au cours des pathologies chroniques d’intérêt

  • Étudier la réponse inflammatoire des barrières
  • Observer les barrières par Imagerie
  • Développer des biomarqueurs d’imagerie et moléculaires

​2) Définir le rôle du microbiote intestinal dans les dysfonctions des barrières

  • Étudier le microbiote (analyse et développement d’outils bioinformatiques)
  • Caractériser le rôle des vésicules extracellulaires produites par les bactéries

3) Intégrer et analyser l’ensemble des données générées afin d’établir des cartographies transcriptionnelles des interactions microbiote/barrières de l’hôte

  • Étudier les barrières d’organe
  • Analyser le transcriptome des cellules épithéliales de l’hôte
  • Analyser le microbiote par des techniques de métaséquençage

4) Cibles thérapeutiques : renforcement des barrières

  • Étudier le potentiel de ciblage d’une affitine sélectionnée
  • Sélectionner un cocktail de bactéries pour concevoir un probiotique
  • Tester des probiotiques et prébiotiques dans le cadre de partenariats industriels

Le consortium de Mibiogate accueille 5 thésards et 2 post-doctorants en co-tutelle répartis sur l’ensemble des 8 laboratoires académiques de la région Pays de la Loire.

Thèse 1 : Dysfonctionnement des barrières dans les allergies respiratoires/asthme
Encadrants : Pr Antoine Magnan (UMR1087 IT) / Dr Grégory Bouchaud (UMR1268 BIA)

Thèse 2 : Dysfonctionnement des barrières dans les MICI (Maladies Chroniques Inflammatoires de l’Intestin)
Encadrants : Dr Malvyne Rolli-Derkinderen (UMR1235 TENS) / Dr Marie Bodinier (UMR1268 BIA)

Thèse 3 : Dysfonctionnement des barrières dans les pathologies développementales
Encadrants : Dr Michel Neunlist (UMR1235 TENS) / Dr Patricia Parnet (UMR1280 PhAN)

Thèse 4 : Contribution des vésicules extracellulaires issues du microbiote dans la physiopathologie des atteintes hépatiques
Encadrants : Dr Ramaroson Andriantsitohaina (UMR1063 SOPAM) / Dr Jérôme Boursier (EA3859 HIFIH)
Doctorant : Alexandre Villard

Thèse 5 : Développement d’outils d’étude et de vectorisation des barrières
Encadrants : Dr Axelle Renodon-Cornière (UMR1232 CRCINA) / Dr Michel Neunlist (UMR1235 TENS)

Post-Doctorat 1 : Analyse Bioinformatique et biostatistique du microbiote
Encadrants : Dr Emmanuel Montassier (EA3826 MiHAR)

Post-Doctorat 2 : Ciblage thérapeutique des barrières par les vésicules extracellulaires
Encadrants : Dr Ramaroson Andriantsitohaina (UMR1063 SOPAM) / Dr Hélène Boudin (UMR1235 TENS)
Post-Doctorante : Dr Nadia Benabbou